ECOTONE propose plusieurs niveaux d'intervention, de la réalisation de pré-diagnostics, qui permettent de valider ou non la faisabilité des projets, jusqu'à la définition des impacts et de mesures de réduction ou de compensation. Les livrables peuvent être directement intégrés dans le volet écologique des études réglementaires nécessaires.
ECOTONE réalise ainsi des suivis naturalistes ciblés sur certains groupes d'espèces ou non (avifaune sur des parcs éoliens par exemple), sur une période plus ou moins longue.
Le principe BACI (Before After Control Impact / contrôle des impacts par rapport à l'état initial) est l’une des méthodes utilisées par ECOTONE, et repose sur des recensements annuels post-implantation.
Dans le cadre de mesures d'accompagnement de projets, ECOTONE participe également à des suivis de mortalité sur certains sites pour évaluer la mortalité entraînée par l'activité d'éoliennes (chauves-souris et oiseaux).